반응형 persistence length3 5. Research[Characteristics study of TATA box through comparison of elastic modulus according to DNA sequence] 5.1. Modeling A previous study, 'Helix's Elasticity Study', shows that in order to form a coordinate system necessary for the calculation process, a two-dimensional figure must be created using atoms. The methods attempted in this study include a method to obtain elasticity by thinking of the template and auxiliary strands of DNA as individual helices, a method to create a two-dimensional figure.. 2021. 11. 11. 5. Conclusion[The elasticity of alpha-helix, pi-helix] 5.1. 요약 및 정리 본 연구에서는 VMD, NAMD 및 PuTTY 등의 프로그램을 이용하여 단백질의 나선 구조(helix)에 대한 연구를 수행하였다. 우리는 단백질 2차 구조의 종류별로 alpha-helix, pi-helix, 3_10-helix로 나누어서 각각의 helix에 대하여 연구를 진행 하였으며 NAMD를 통해 Waterbox라는 field 내에서 각각의 helix가 변화 할 때의 휘어짐 정도와 탄성 계수(bending-modulus)를 관찰하여 비교하였다. 본 연구 팀은 아미노산의 종류 중 알라닌(alalnin)으로만 이루어진 alpha-helix, pi-helix에 관해 연구를 진행하였는데, 알라닌으로만 구성된 alpha-hellix, pi-helix가 Waterbox 안에서 영향을 받을.. 2021. 11. 3. 4. Result[The elasticity of alpha-helix, pi-helix] 4.1. Graph Case 1(alpha-helix) Case 2(alpha-helix) Case 3(alpha-helix) Case 4(alpha-helix) Case 5(pi-helix) 4.2. Table alpha_1 alpha_2 alpha_3 omega_01 omega_02 omega_03 Case 1 647.5687953 680.6992068 52.98290197 -0.003612644 -0.00700033 -0.150522647 Case 2 355.7032145 310.6590218 14.61982475 -0.016799677 -0.003928091 -0.167903695 Case 3 663.193241 593.4287116 97.53139377 0.000214717 -0.01230642.. 2021. 11. 3. 이전 1 다음 반응형
